トマト属
トマト属（Lycopersicon）は、ナス属の中のPotatoe亜属に属する。 トマト属のセクション(節)は、トマト（Solanum lycopersicum）と、一般的にワイルドトマトとして知られている近縁の自然種からなる単系統のクラードである。 これらの種はいずれも、有害な生物学的要因（病害虫）や非生物学的要因（水ストレスや塩ストレスなど）に対する抵抗性や、果実の品質形質に関する遺伝子を数多く保有しており、トマトの育種にとって極めて重要な遺伝資源となっています。
トマト属には南アメリカ西部に自生する13種が含まれています。 実際のトマト（Solanum lycopersicum）は、16世紀にヨーロッパに到着し、現在では世界中で栽培されており、難民として栽培されることもあります。 長い間、独自のLycopersicon属に分類されていましたが、現在ではナイトシェードに属することが確認されています。
Lycopersicon節は,トマト, Solanum lycopersicumおよびそれに密接に関連する自然発生種,一般的には野生トマトとして知られる種をグループ化する単系統群である。クレードは、エクアドルからチリに生息する南米原産の草本種13種で構成される。12これらの種はすべて,トマトの遺伝的改良のための極めて重要な遺伝資源を構成している。なぜなら,それらの種は,果実の品質特性だけでなく,生物的 (病虫害) および非生物的(例えば水や生理食塩水のストレス)有害因子に対する耐性のための大量の遺伝子を持っているからである。
分類学
分類学上の歴史
16世紀に栽培用のトマトがヨーロッパに導入されて以来、植物学者はこの種がナス属（Solenum）の他の種と密接な関係にあることを認識してきた。 1694年、フランスの植物学者ジョゼフ・ピトン・トゥルヌフォールは、栽培されているトマトを初めて独立した属としてとらえ、 リコペルシカム（Lycopersicum：ギリシャ語で「狼の桃」の意）と命名した。 しかし、現在では多くのナス属の種が果実に多くの空洞やロキュールを持っていることが知られている。
一方、イギリスの植物学者であるフィリップ・ミラーは、トゥルヌフォールの基準に従ってリコペルシコン属（Lycopersicon）を正式に記載した。 その後、ミラーは1768年にリコペルシクム・エスクレントゥム（L. esculentum）、ペルビアナム（L. peruvianum）、ピンピネリフォリウム（L. pimpinellifolium）の診断を発表しています。
ミラーは、ジャガイモ（Solanum tuberosum）と他の2種のナス属（Solanum）をリコペルシカム属（Lycopersicum）に含めていたが、後の研究では、この2つの属を直接統合した。 ミラーとトゥルヌフォールの研究を受けて、フランスのミシェル・フェリックス・デュナル、イギリスのジョージ・ベンサムやジョセフ・ダルトン・フッカーが分類体系の中でリコペルシコン属（Lycopersicon）をナス属とは異なる属として認めた古典的、近代的な植物学者は数多くいます。 アメリカのドノヴァン・コレル、オーストラリアのデビッド・エリック・サイモン、そしてカナダ出身のウィリアム・ダーシーとアルゼンチンのアルマンド・テオドロ・フンツィカーという2人の著名なナス科の分類学者、また、トマトと関連する野生種を専門としていたアメリカの遺伝学者チャールズ・M・リックもリコペルシコン属（Lycopersicon）を認めています。
外部分類
ナス科（Solanum）の中で、Lycopersiconの項はPotatoe亜属に分類される。 形態学的および分子レベルで行われたクラディズム研究により、このセクションは単系統であることが示されている。 これらの調査で判明した近縁種のセクションとの関係を以下のクラドグラムに示します。
| トマト属（Lycopersicon） |
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内部分類
このセクションでは、13の種が区別されています。
ネオリコペルシコングループ
- Solanum pennellii Corell：ペルー、ガラパゴス諸島。
Eriopersiconグループ
- Solanum chilense (Dunal) Reiche: ペルーからチリ北部、ガラパゴス諸島まで。
- Solanum corneliomulleri J.F.Macbride: ペルー.
- Solanum habrochaites S.Knapp & D.M.Spooner: エクアドルからペルー.
- Solanum huaylasense Peralta：ペルー。
- Solanum peruvianum L.: エクアドルからチリ、ガラパゴス諸島。
アルカヌムグループ
- Solanum arcanum Peralta：ペルー。
- Solanum chmielewskii (C.M.Rick, Kesicki, Fobes & M.Holle) D.M Spooner, G.J.Anderson & R.K.Jansen: ペルーからボリビアまでである。
- Solanum neorickii D.M.Spooner, G.J.Anderson & R.K.Jansen：エクアドル～ペルー。
リコペルシコングループ
- Solanum cheesmaniae (L. Riley) Fosberg: ガラパゴス諸島.
- Solanum galapagense S. C. ダーウィン＆ペラルタ：ガラパゴス諸島。
- トマト（Solanum lycopersicum）L.
- Solanum pimpinellifolium L.: エクアドルからチリ、ガラパゴス諸島。
種間のクラッド的な関係はまだ疑いの余地なく明らかにされていない。しかし、Solanum pennelliiが他のすべての種の基底にあると仮定すると、本種は単型のNeolycopersiconグループに入れられる。Eriopersiconグループの4種は、ほとんどが枝分かれした花序と緑色の果実を形成します。また、自殖性で非分枝の花序に緑色の果実をつける3種は、Arcanumグループに入れられている。赤からオレンジ色の果実を持つ4種がLycopersiconグループを形成しています。