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トマト研究所は、トマトについて生物学、植物学、遺伝子学、科学または化学など、多分野で学術的に研究発表された論文や資料の一覧である。

研究には実験、および実験結果も必要であるが、理論も必要である。
よって、実験を伴わない理論、もしくは推論も含まれる。

また、トマトの専門学者や研究者に関わらず、素人を含む個人的なトマトの研究や理論を自由に発表して閲覧してもらう有意義な場として本項であるトマト研究所は設立された。

🍅 本項はトマトの研究に関するものを記す。
従って、トマトの研究所や研究施設をピックアップするものではない。

• 栽培技術に関しては、農学と栽培技術を参照。
  
• 品種改良に関しては、トマトの品種改良を参照。
  
• ブリーダーに関しては、トマトブリーダーを参照のこと。